Nato a Chicago, nel 1947, Stuart Gordon aveva iniziato la sua carriera sul palcoscenico, fondando dopo gli studi universitari l’Organic Theater.
Dopo il teatro e prime esperienze sul piccolo schermo, con la serie P/S – Pronto soccorso
e il film per la TV Bleacher Bums.
Nel 1985 l’esordio sul grande schermo con l'horror splatter Re-Animator, realizzato in collaborazione con l’amico Brian Yuzna.
Tra le altre pellicole realizzate nel corso della sua carriera ricordiamo anche From Beyond – Terrore dall’ignoto, Dolls, 2013 – La fortezza e Edmond.
Tra il 2005 e il 2006 aveva anche diretto due episodio della serie Masters of Horror, nello specifico H.P. Lovecraft’s Dreams in the Witch-House e Il gatto nero.